MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008148	GCAGA	2	10	4	13	40 %	0 %	40 %	20 %	108802857
2	NC_008148	AG	3	6	166	171	50 %	0 %	50 %	0 %	108802857
3	NC_008148	GGA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
4	NC_008148	AGG	2	6	219	224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
5	NC_008148	CAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802857
6	NC_008148	GGGC	2	8	247	254	0 %	0 %	75 %	25 %	108802857
7	NC_008148	GC	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	108802857
8	NC_008148	GAG	2	6	275	280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
9	NC_008148	CGCT	2	8	329	336	0 %	25 %	25 %	50 %	108802857
10	NC_008148	CGC	3	9	394	402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802857
11	NC_008148	CGT	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802857
12	NC_008148	G	7	7	455	461	0 %	0 %	100 %	0 %	108802857
13	NC_008148	GCGG	2	8	487	494	0 %	0 %	75 %	25 %	108802857
14	NC_008148	AGGACC	2	12	510	521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
15	NC_008148	ACG	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
16	NC_008148	TCC	2	6	633	638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802857
17	NC_008148	GAC	2	6	644	649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
18	NC_008148	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
19	NC_008148	CTT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802857
20	NC_008148	GAG	2	6	716	721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
21	NC_008148	TCC	2	6	855	860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802857
22	NC_008148	ATG	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802857
23	NC_008148	GAC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
24	NC_008148	GGAG	2	8	949	956	25 %	0 %	75 %	0 %	108802857
25	NC_008148	CCTC	2	8	981	988	0 %	25 %	0 %	75 %	108802857
26	NC_008148	CGGC	2	8	991	998	0 %	0 %	50 %	50 %	108802857
27	NC_008148	GCTG	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	108802857
28	NC_008148	AGG	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802857
29	NC_008148	AG	3	6	1187	1192	50 %	0 %	50 %	0 %	108802857
30	NC_008148	CGA	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802857
31	NC_008148	TCCC	2	8	1205	1212	0 %	25 %	0 %	75 %	108802857
32	NC_008148	CGG	2	6	1231	1236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802857
33	NC_008148	CAAC	2	8	1263	1270	50 %	0 %	0 %	50 %	108802857
34	NC_008148	G	6	6	1908	1913	0 %	0 %	100 %	0 %	108802858
35	NC_008148	CT	3	6	1982	1987	0 %	50 %	0 %	50 %	108802858
36	NC_008148	CT	3	6	2003	2008	0 %	50 %	0 %	50 %	108802858
37	NC_008148	GGA	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
38	NC_008148	GC	3	6	2063	2068	0 %	0 %	50 %	50 %	108802858
39	NC_008148	GAT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802858
40	NC_008148	ACG	2	6	2121	2126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
41	NC_008148	GCC	2	6	2138	2143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802858
42	NC_008148	GCTCC	2	10	2146	2155	0 %	20 %	20 %	60 %	108802858
43	NC_008148	CGC	2	6	2185	2190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802858
44	NC_008148	GGA	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
45	NC_008148	GGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
46	NC_008148	TGG	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802858
47	NC_008148	CCCGT	2	10	2304	2313	0 %	20 %	20 %	60 %	108802858
48	NC_008148	CAC	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802858
49	NC_008148	ACC	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802858
50	NC_008148	CCCGG	2	10	2440	2449	0 %	0 %	40 %	60 %	108802858
51	NC_008148	AGG	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
52	NC_008148	TCT	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802858
53	NC_008148	CGA	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
54	NC_008148	TGC	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802858
55	NC_008148	CCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802858
56	NC_008148	CGG	2	6	2604	2609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802858
57	NC_008148	CGA	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
58	NC_008148	CCCG	2	8	2692	2699	0 %	0 %	25 %	75 %	108802858
59	NC_008148	TCT	2	6	2715	2720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802858
60	NC_008148	GGT	3	9	2737	2745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802858
61	NC_008148	GCG	2	6	2751	2756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802858
62	NC_008148	CAG	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
63	NC_008148	GAC	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802858
64	NC_008148	CCT	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802858
65	NC_008148	GTC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802858
66	NC_008148	GAG	3	9	2921	2929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802858
67	NC_008148	TCCC	2	8	2965	2972	0 %	25 %	0 %	75 %	108802858
68	NC_008148	TGA	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802858
69	NC_008148	CGGC	2	8	2990	2997	0 %	0 %	50 %	50 %	108802859
70	NC_008148	CGG	2	6	3042	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802859
71	NC_008148	CGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802859
72	NC_008148	GC	3	6	3123	3128	0 %	0 %	50 %	50 %	108802859
73	NC_008148	CGT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802859
74	NC_008148	G	6	6	3147	3152	0 %	0 %	100 %	0 %	108802859
75	NC_008148	CTC	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
76	NC_008148	TCG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
77	NC_008148	CCT	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
78	NC_008148	TCG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
79	NC_008148	CTC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
80	NC_008148	GTC	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
81	NC_008148	G	6	6	3364	3369	0 %	0 %	100 %	0 %	108802860
82	NC_008148	GGT	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802860
83	NC_008148	GCA	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
84	NC_008148	GCGG	2	8	3521	3528	0 %	0 %	75 %	25 %	108802860
85	NC_008148	CTT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802860
86	NC_008148	GAC	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
87	NC_008148	CTC	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
88	NC_008148	CGGC	2	8	3615	3622	0 %	0 %	50 %	50 %	108802860
89	NC_008148	GCG	2	6	3633	3638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802860
90	NC_008148	CAG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
91	NC_008148	GCT	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
92	NC_008148	GCG	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802860
93	NC_008148	CTC	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802860
94	NC_008148	TGC	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
95	NC_008148	GC	3	6	3770	3775	0 %	0 %	50 %	50 %	108802860
96	NC_008148	CGA	2	6	3794	3799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
97	NC_008148	GCC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802860
98	NC_008148	AG	3	6	3897	3902	50 %	0 %	50 %	0 %	108802860
99	NC_008148	GAC	2	6	3954	3959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
100	NC_008148	CAC	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802860
101	NC_008148	CAG	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
102	NC_008148	CGC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802860
103	NC_008148	TGC	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802860
104	NC_008148	CGA	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
105	NC_008148	GAGC	2	8	4109	4116	25 %	0 %	50 %	25 %	108802860
106	NC_008148	CGA	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802860
107	NC_008148	CCA	3	9	4180	4188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802860
108	NC_008148	GCG	2	6	4217	4222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802860
109	NC_008148	TGG	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802860
110	NC_008148	GTG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802860
111	NC_008148	TCCA	2	8	4509	4516	25 %	25 %	0 %	50 %	108802861
112	NC_008148	GCG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
113	NC_008148	CAC	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802861
114	NC_008148	CGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
115	NC_008148	CCG	3	9	4747	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802861
116	NC_008148	TCA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802861
117	NC_008148	CGG	2	6	4781	4786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
118	NC_008148	CGG	2	6	4817	4822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
119	NC_008148	GGT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802861
120	NC_008148	GCC	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802861
121	NC_008148	CAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802861
122	NC_008148	CGA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
123	NC_008148	GAG	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
124	NC_008148	GTC	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
125	NC_008148	G	6	6	5147	5152	0 %	0 %	100 %	0 %	108802861
126	NC_008148	GAG	3	9	5226	5234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
127	NC_008148	CAA	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802861
128	NC_008148	GCAC	2	8	5326	5333	25 %	0 %	25 %	50 %	108802861
129	NC_008148	GCT	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
130	NC_008148	AAGGAG	2	12	5400	5411	50 %	0 %	50 %	0 %	108802861
131	NC_008148	CGA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
132	NC_008148	GCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
133	NC_008148	AGACCA	2	12	5494	5505	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	108802861
134	NC_008148	TCG	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
135	NC_008148	CCA	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802861
136	NC_008148	GGA	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
137	NC_008148	GC	3	6	5631	5636	0 %	0 %	50 %	50 %	108802861
138	NC_008148	CTC	2	6	5717	5722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802861
139	NC_008148	GAGC	2	8	5738	5745	25 %	0 %	50 %	25 %	108802861
140	NC_008148	CGG	2	6	5767	5772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802861
141	NC_008148	GCAGG	2	10	5786	5795	20 %	0 %	60 %	20 %	108802861
142	NC_008148	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802861
143	NC_008148	GC	3	6	5946	5951	0 %	0 %	50 %	50 %	108802861
144	NC_008148	TCA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802861
145	NC_008148	CCGACG	2	12	5974	5985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108802861
146	NC_008148	ACGTCT	2	12	6112	6123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108802861
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148	NC_008148	GCA	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802861
149	NC_008148	ACC	2	6	6234	6239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802861
150	NC_008148	GCT	2	6	6260	6265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802861
151	NC_008148	CCG	2	6	6292	6297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802861
152	NC_008148	GAA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802861
153	NC_008148	TCCT	2	8	6445	6452	0 %	50 %	0 %	50 %	108802862
154	NC_008148	CGG	2	6	6523	6528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
155	NC_008148	GTC	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
156	NC_008148	ACC	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802862
157	NC_008148	CGG	2	6	6635	6640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
158	NC_008148	TGG	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
159	NC_008148	CGG	3	9	6734	6742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
160	NC_008148	GC	3	6	6760	6765	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
161	NC_008148	TGC	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
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164	NC_008148	CGC	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802862
165	NC_008148	CGA	3	9	6996	7004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802862
166	NC_008148	GC	3	6	7012	7017	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
167	NC_008148	GTG	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
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169	NC_008148	CA	3	6	7124	7129	50 %	0 %	0 %	50 %	108802862
170	NC_008148	GTC	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802862
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174	NC_008148	GGT	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802862
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225	NC_008148	TGA	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802862
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230	NC_008148	GCCG	2	8	8910	8917	0 %	0 %	50 %	50 %	108802862
231	NC_008148	CGG	2	6	8922	8927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802862
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244	NC_008148	CCGC	2	8	9641	9648	0 %	0 %	25 %	75 %	108802863
245	NC_008148	GGC	2	6	9658	9663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802863
246	NC_008148	ACC	2	6	9734	9739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802863
247	NC_008148	GGT	3	9	9819	9827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802863
248	NC_008148	CCT	2	6	9851	9856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802863
249	NC_008148	ACC	2	6	9857	9862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802863
250	NC_008148	CCG	2	6	9872	9877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802863
251	NC_008148	GCT	2	6	9900	9905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802863
252	NC_008148	GGC	2	6	9918	9923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802863
253	NC_008148	GCG	2	6	9936	9941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802863
254	NC_008148	GCGG	2	8	9981	9988	0 %	0 %	75 %	25 %	108802863
255	NC_008148	AAG	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802863
256	NC_008148	CG	3	6	10016	10021	0 %	0 %	50 %	50 %	108802863
257	NC_008148	AGC	2	6	10037	10042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802863
258	NC_008148	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802863
259	NC_008148	CGA	2	6	10068	10073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802863
260	NC_008148	AAG	2	6	10090	10095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802863
261	NC_008148	GTG	2	6	10108	10113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802863
262	NC_008148	GAG	2	6	10150	10155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802863
263	NC_008148	AGC	2	6	10196	10201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802863
264	NC_008148	GAG	2	6	10222	10227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802863
265	NC_008148	GACG	2	8	10233	10240	25 %	0 %	50 %	25 %	108802863
266	NC_008148	AGGG	2	8	10246	10253	25 %	0 %	75 %	0 %	108802863
267	NC_008148	GGA	2	6	10275	10280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802863
268	NC_008148	TGG	2	6	10346	10351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802863
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271	NC_008148	GAG	2	6	10408	10413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802863
272	NC_008148	TGG	2	6	10415	10420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802863
273	NC_008148	CTG	2	6	10435	10440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802863
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280	NC_008148	GCA	2	6	10679	10684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802864
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285	NC_008148	GAT	2	6	10839	10844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802864
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289	NC_008148	AGCG	2	8	11038	11045	25 %	0 %	50 %	25 %	108802865
290	NC_008148	CTT	2	6	11061	11066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802865
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293	NC_008148	GCG	2	6	11169	11174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802865
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299	NC_008148	TCA	2	6	12064	12069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802866
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301	NC_008148	CTA	2	6	12137	12142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802866
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303	NC_008148	TCC	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802866
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